上海国家应用数学中心成立于2020年，设有复旦大学分中心和上海交通大学分中心，是科技部首批支持的国家应用数学中心之一:
综合上海各高校及科研机构的学科交叉优势
搭建应用数学与产业发展交叉、交融的有效平台
汇聚促进应用数学及新型、新兴产业发展的资源
建立数学家与企业、产业专家交流机制
提升数学支撑上海市及国家创新发展的源头动力
近期重点建设方向/主要研究团队
航空工程数学应用
对流体力学和玻尔兹曼方程，发展了多尺度不确定性量化计算方法。
主要团队成员:
金石 李磊 刘洪 王亚光 应文俊
合作单位:
中国商用飞机有限责任公司上海飞机设计研究院、北京大学、中国科学院数学与系统科学研究院、 中国航空工业集团公司沈阳空气动力研究所
计算生物学
基于实验数据的神经科学与生物系统建模与分析，应用于揭示脑神经系统工作原理以及脑启发的机器学习和人工智能领域。
主要团队成员:
胡丹 李松挺 Jakob ULMSCHNEIDER-MAYER
合作单位:
商汤科技、中国科学院深圳先进技术研究院、中国科学院上海生命科学研究院神经所
人工智能与图像处理
研究深度学习理论，优化算法，与物理模型的交叉及在图像,数据分析中的应用，运用于生物、医学、工程等交叉领域。
主要团队成员:
刘林 Nana LIU 刘卫东 罗涛 马征 许志钦 张小群 张耀宇
合作单位:
商汤科技、上海交通大学医学院附属仁济医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院
分子动力学
发展长程多体系统的基本算法和理论，建立动理学和多尺度模型，应用于药物设计、能源存储等科学问题，推进产学研结合工作。
主要团队成员:
洪亮 金石 李磊 张何朋 张镭
合作单位:
金赛药业、华院数据
